Los científicos de Ludwig Cancer Research han desarrollado con el uso de IA un modelo predictivo que puede identificar las células inmunes que matan el cáncer y que tienen el mayor potencial para usarse en inmunoterapias. Esta herramienta, TRTpred, se describe especialmente y en detalle en la prestigiosa revista Nature Biotechnology.
Personalización de los tratamientos contra el cáncer
El modelo TRTpred respaldado por algoritmos se puede integrar en tratamientos contra el cáncer individualizados y terapias personalizadas basadas en la firma de las células precancerosas de cada paciente. Como mencionó Alexander Harari de Ludwig Lausanne, investigador principal del trabajo, una técnica tan novedosa puede ofrecer un nuevo conjunto de subsidios a los pacientes.
Las células inmunitarias que se encuentran en el cáncer transferidas a un paciente, conocidas como linfocitos infiltrantes de tumores (TIL), forman la base de la inmunoterapia celular. Luego, estos TIL podrían modularse opcionalmente para aumentar sus capacidades sinérgicas intrínsecas contra el cáncer y luego reintroducirse en el cuerpo después de ampliarse en cultivo. Sin embargo, no todos los TIL atienden con éxito las células sospechosas de tener tumores, y solo una fracción es reactiva a los tumores.
Harari y su equipo idearon TRTpred, un enfoque de modelado predictivo impulsado por IA que les permite clasificar los receptores de células T (TCR) según su reactividad tumoral. A medida que TRTpred identifica genes responsables de la secreción tumoral, puede crear una regla que se aplicará a una nueva población y luego predecir con precisión si un TCR es una célula reactiva a tumores o no.
TRTpred: un revolucionario impulsado por la IA
Los científicos mejoraron la calidad del primer paso con filtros algorítmicos con el objetivo de encontrar células T portadoras de antígenos tumorales de alta avidez, es decir, aquellas capaces de unirse fuertemente al antígeno. Además, se añadió un tercer filtro con el objetivo de diferenciar mejor los antígenos de las células tumorales, lo que contribuye a la focalización de múltiples antígenos.
El equipo extrajo los TCR de TIL y utilizó MixTRTpred (una combinación de la técnica TRTpred y filtros de algoritmos) para identificar las células T que podrían ser útiles para atacar tumores que son de alta avidez y específicos para múltiples antígenos tumorales. Estas células T modificadas genéticamente se introdujeron con éxito en los ratones, donde la eliminación de los tumores fue evidente cuando se completó el xenoinjerto, proporcionando así una prueba del método.
George Coukos, director de Ludwig Lausanne y coautor del estudio, tiene la intención de iniciar lo antes posible un ensayo clínico de fase I en humanos para probar la tecnología. Dijo que tenía grandes esperanzas en el rendimiento del método, ya que creía que solucionaría las deficiencias actuales de las terapias basadas en TIL. En concreto, aquellos pacientes cuyos tumores no reaccionan como se supone que deben hacerlo hoy en día.
