Według BlockBeats, 12 września ZKsync oficjalnie uruchomił swój system zarządzania łańcuchem. Ramy zarządzania zostały zaprojektowane wokół zasad rozdziału władzy oraz kontroli i równowagi. Zgodnie z projektem żadna osoba ani podmiot nie ma uprawnień do zmiany protokołu ZKsync. Wszystkie zmiany protokołu muszą zostać zatwierdzone przez trzy niezależne organy, z których każdy sprawuje niezależny osąd i kontrolę nad swoimi decyzjami: społeczność posiadaczy tokenów, radę bezpieczeństwa i powierników o wartościach, którzy zapewniają wdrożenie propozycji.

Zgromadzenie posiadaczy tokenów pozwala posiadaczom tokenów i ich przedstawicielom na bezpośrednie składanie i głosowanie nad aktualizacjami protokołu w łańcuchu. Rada ds. bezpieczeństwa, złożona z ekspertów technicznych, jest odpowiedzialna za przeglądanie i zatwierdzanie aktualizacji protokołu i ma prawo zamrozić protokół w sytuacjach awaryjnych. Opiekunowie zapewniają, że propozycje dotyczące zarządzania są zgodne z wartościami etosu ZKsync.

System zarządzania obsługuje trzy rodzaje propozycji: propozycje udoskonaleń ZKsync (ZIP), propozycje planów tokenów (TPP) i propozycje doradztwa w zakresie zarządzania (GAP).