Ludviga vēža izpētes zinātnieki Izmantojot mākslīgo intelektu, ir izstrādājuši prognozēšanas modeli, kas var identificēt vēzi nogalinošas imūnās šūnas, kurām ir vislielākais potenciāls, ko izmantot imūnterapijā. Šis rīks TRTpred ir īpaši detalizēti aprakstīts augsta līmeņa žurnālā Nature Biotechnology.

Vēža ārstēšanas personalizēšana

TRTpred modeli, ko atbalsta algoritmi, var integrēt individuālā vēža ārstēšanā un pielāgotā terapijā, pamatojoties uz katra pacienta pirmsvēža šūnu parakstu. Kā minēja darba galvenais pētnieks Ludviga Lozannas kungs Aleksandrs Harari, šāda jauna tehnika var dot pacientiem jaunu subsīdiju kopumu.

Vēzī konstatētās imūnās šūnas, kas pārnestas uz pacientu, kas pazīstamas kā audzēju infiltrējošie limfocīti (TIL), veido šūnu imūnterapijas pamatu. Pēc tam šos TIL varētu pēc izvēles modulēt, lai palielinātu to raksturīgās sinerģiskās spējas pret vēzi, un pēc tam tos atkārtoti ievadītu organismā pēc kultūras palielināšanas. Tomēr ne katrs TIL veiksmīgi apstrādā audzēju aizdomīgas šūnas, un tikai daļa ir reaktīva pret audzēju.

Harari un viņa komanda nāca klajā ar TRTpred, AI vadītu prognozēšanas modelēšanas pieeju, kas ļauj klasificēt T šūnu receptorus (TCR) pēc to audzēja reaktivitātes. Tā kā TRTpred identificē gēnus, kas ir atbildīgi par audzēja sekrēciju, tas var izveidot noteikumu, kas tiks piemērots jaunai populācijai, un pēc tam precīzi paredzēt, vai TCR ir ar audzēju reaģējoša šūna vai nē.

TRTpred: AI vadīts spēļu mainītājs

Zinātnieki uzlaboja iepriekšējā posma kvalitāti ar algoritmiskiem filtriem, kuru mērķis bija atrast audzēja antigēnu saturošas T-šūnas ar augstu aviditāti, proti, tās, kas spēj spēcīgi saistīt antigēnus. Turklāt tika pievienots trešais filtrs, lai labāk diferencētu audzēja šūnu antigēnus, kas veicina vairāku antigēnu mērķēšanu.

Komanda ekstrahēja TIL TCR un izmantoja MixTRTpred (TRTpred tehnikas un algoritmu filtru kombinācija), lai identificētu T šūnas, kas varētu būt noderīgas, lai uzbruktu audzējiem, kuriem ir augsta aviditāte un specifiski vairākiem audzēja antigēniem. Šīs inženierijas T šūnas tika veiksmīgi ievadītas pelēm, kur audzēju likvidēšana bija acīmredzama, kad ksenotransplantāts bija pabeigts, tādējādi nodrošinot metodes pierādījumu.

Džordžs Kukoss, Ludviga Lozannas direktors un pētījuma līdzautors, plāno pēc iespējas ātrāk uzsākt I fāzes klīnisko izpēti ar cilvēkiem, lai pārbaudītu tehnoloģiju. Viņš norādīja, ka viņam ir lielas cerības uz metodes veiktspēju, jo uzskatīja, ka tā novērsīs pašreizējos uz TIL balstītās terapijas trūkumus. Konkrēti, tie pacienti, kuru audzēji nereaģē tā, kā šodien vajadzētu.